Dre Hussin et son équipe cherche des mutations dans le SARS-COV-2, le virus responsable de la maladie COVID-19

Le travail de Dre Hussin et de son groupe de recherche consiste à résoudre des questions biologiques à l’aide d’outils de calcul d’informatique de pointe. Ces jours-ci, l’équipe cherche des mutations dans le SARS-COV-2, le virus responsable de la maladie COVID-19.

« À la base, c’était un petit projet avec mon bio-informaticien senior, raconte-t-elle. On prenait toutes les séquences qui apparaissaient de semaine en semaine et on regardait comment elles mutaient d’une génération à l’autre, selon le pays.»

« On a découvert de la variabilité », précise-t-elle. Cette variabilité est le pain quotidien de cette équipe de spécialistes en génétique des populations.

Pourquoi étudier la variabilité ? La première fois que SARS-COV-2 a infecté un humain, son génome contenait une certaine séquence d’ARN (tandis que le génome humain est composé d’ADN). Lorsque le virus crée des répliques de lui-même, des erreurs aléatoires peuvent s’infiltrer dans la séquence d’ARN. Les effets de ces mutations peuvent s’avérer bénéfiques, nuisibles ou inconséquents pour le virus. Dans tous les cas, elles risquent d’engendrer de nouvelles souches. Les pressions qui varient d’un humain à l’autre ou même à l’intérieur d’un individu influencent la survie, la réplication et la transmission des différentes souches. Certaines souches pourraient donc développer des avantages spécifiques.

Source : Calcul Québec, consulter l’article complet sur le site de Calcul Québec, https://www.calculquebec.ca/recherche/3154/