Plateforme métabolomique

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La plateforme métabolomique procède à des analyses métabolomiques, dont la lipidomique, ciblées et non ciblées par la spectrométrie de masse (chromatographie gazeuse et liquide : GC-MS, LC-MS/MS) appliquées à diverses classes de métabolites: phospholipides, cholestérol, sphingolipides, acylcarnitines, acides biliaires, acides gras, acides organiques et acides aminés.

Nous pouvons faire des analyses dans plusieurs types de matrices biologiques telles que plasma, sérum, globues rouges, mitochondries, tissus d'animaux (coeur, foie, muscle, cerveau ou autres) ou autres espèces (ex: C. elegans) selon vos besoins.

Phénotypage métabolique et fonctionnel du coeur de souris par le biais de sa perfusion ex vivo en mode travaillant en présence de substrats marqués au carbone 13.
Investigations métaboliques: analyse de flux métaboliques basée sur l’utilisation des substrats avec des isotopes stables et la spectrométrie de masse. 

Membres de l'équipe

Directrice de la plateforme: Christine Des Rosiers 
Co-directeur de la plateforme: Matthieu Ruiz


Assistants & associés de recherche :

Bertrand Bouchard, M.Sc. microbiologie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), incluant la préparation d'échantillons; Courriel : bertrand.bouchard@mhi-rc.org

Lise Coderre, Ph.D. biologie moléculaire : Expertise en syndrome métabolique et diabète, signalisation moléculaire; Courriel : lise.coderre@umontreal.ca

Caroline Daneault, M.Sc. biochimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : caroline.daneault@icm-mhi.org

Anik Forest, M.Sc. physique et chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS/LC-MS/MS) et analyse des résultats ("data mining"); Courriel : anik.forest@mhi-rc.org

Isabelle Robillard Frayne, M.Sc. chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : isabelle.robillard-frayne@mhi-rc.org

Julie Thompson Legault, M.Sc.nutrition : Expertise en métabolomique et coordination d'étude clinique; Courriel : julie.thompson@mhi-rc.org
Projet(s) de recherche

Les principaux projets en cours sont subventionnés par des organismes avec comités de pairs, soit les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), Génome Canada/Québec, la Fondation canadienne pour l'innovation (FCI).

  1. “Metabolic investigations using mass isotopomer analysis: A paradigm for biomarker and therapy discovery.” IRSC (2010-2015); subvention de fonctionnement; rôle: Investigateur principal (IP) (2 co-applicants).
  2. « Emerging team in the Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC): Translating LSFC gene discovery into treatments for patients.” IRSC (2010-2015); Subvention d’équipe; rôle: Chef d’équipe (7 co-applicants).
  3. “IBD Genomic Medicine Consortium (iGenoMed): translating genetic discoveries into a personalized approach to treating inflammatory bowel diseases.” Genome Canada (2012-2016). Rôle : Co-applicant (IP : Drs J. Rioux et A. Bitton; 9 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
  4. Discovery, development and validation of biomarkers and theragnostic approaches. FCI (2009-2014). Rôle: Co-applicant (IP: Dr JC Tardif; 3 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
Publications

Pubmed : C. Des Rosiers

Prix et distinctions

Les étudiants du laboratoire sont souvent récompensés pour leurs présentations orales ou par affiche lors des Journées de la Recherche de l'Institut de Cardiologie de Montréal.

La plupart de nos étudiants sont également financés par des bourses octroyées par divers organismes.

Anciens étudiants :

Matthieu Ruiz
2014, 2017 et 2018 : Prix pour présentations orales et par affiche, congrès SQLNM-CMDO-COLosSUS
2017: “William C. Stanley” Early Investigator award, congrès SHVM, Allemagne
2016 et 2017 : 1er prix présentation par affiche, niveau post-doctorat, ICM
2017 : Prix d’excellence pour une communication orale, congrès SQLNM-CMDO-COLosSUS
2017: Récipiendaire du ASBMB Graduate/Postdoctoral Travel award, EB 2017, Chicago, USA.
2016 : 1er prix présentation orale, département de nutrition, UdeM
2014 : 1er prix séminaire post-doctoral et 1er prix présentation orale niveau post-doctorat, ICM
2014 : Lauréat sélectionné sur critères d’excellence académique par le CMDO pour participation invitée aux 2nd ICAN (Institute of Cardiometabolism And Nutrition) Conference Series, France

Sandra Therrien-Laperrière

2017 : Travel award- Experimental Biology, ASMBM
2016: Bourse d’excellence, FESP Université de Montréal
2016 : 1er prix présentation par affiche, niveau maîtrise, ICM

Yvette Mukanesa
2017: Travel award – Experimental Biology, ASBMB
2014 et 2016: Bourse d’excellence académique et du MSSS, Quebec Black Medical Association 2014: 1er prix présentation par affiche niveau doctorat, ICM
2014-2015: Bourse CORAMH
2011-2017: Bourses de la faculté de médecine, du département de nutrition et FESP, UdeM

Sarah Cherkaoui
2015: Travel award, International Conference of the Metabolomics Society
2013-2015 : Bourse de maîtrise, FESP, UdeM
2014 : 1er prix présentation par affiche niveau maîtrise - Département de Biochimie – UdeM

Cécile Martel
2013 : 1er prix présentation par affiche niveau post-doctorat, ICM
2013-15 : Bourse post-doctorale FRQS

Marie-Eve Rivard
2010: 1er prix présentation orale niveau maîtrise, ICM

Julie Thompson-Legault
2012 : CORAMH
2011 et 2012 : Fondation Go (devenue fondation du Grand défi Pierre Lavoie)
2010-2012 : Bourse de maîtrise FRQS

Roselle Gélinas
2011 : Bourse «Graduate/Postdoctoral travel award», ASBMB 2011, USA
2011: Prix et bourse “Early Investigator Competition”, Society for Heart and Vascular Metabolism, Belgique
2009-2011: Bourse Ph.D. IRSC
2007 et 2009 : 1er et 2e prix pour meilleure présentation orale niveau doctorat, ICM
2008 : Bourse pour étudiant au Ph.D. (rédaction), Département de Nutrition, UdeM
2006 et 2008 : Bourse de voyage pour congrès (EB 2007, 2009), Département de Nutrition, UdeM
2006 et 2008 : 3e et 2e prix pour la meilleure présentation par affiche niveau doctorat, ICM
2006 et 2007 : Bourse pour étudiant au Ph.D, Département de Nutrition, UdeM
2004 et 2005: Bourse pour étudiant gradué, Département de Nutrition, UdeM

Dominic Lachance
2012 : 2e prix présentation par affiche niveau post-doctorat, ICM
2012-2014 : Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)
2010-2012 : Bourse post-doctorale FRQS et Fondation des maladies du cœur du Canada (FMCC)

Benjamin Lauzier
2011-2012 : Bourse post-doctorale de la FMCC

Fanny Vaillant
2012 : 1er prix présentation orale niveau post-doctorat, ICM
2011: 1er prix de présentation d'un séminaire niveau post-doctorat, ICM

Contact

metabolomique.icm@mhi-rc.org
514 376-3330, poste 2133

Membres de l'équipe

Directrice de la plateforme: Christine Des Rosiers 
Co-directeur de la plateforme: Matthieu Ruiz


Assistants & associés de recherche :

Bertrand Bouchard, M.Sc. microbiologie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS & LC-MS/MS), incluant la préparation d'échantillons; Courriel : bertrand.bouchard@mhi-rc.org

Lise Coderre, Ph.D. biologie moléculaire : Expertise en syndrome métabolique et diabète, signalisation moléculaire; Courriel : lise.coderre@umontreal.ca

Caroline Daneault, M.Sc. biochimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : caroline.daneault@icm-mhi.org

Anik Forest, M.Sc. physique et chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS/LC-MS/MS) et analyse des résultats ("data mining"); Courriel : anik.forest@mhi-rc.org

Isabelle Robillard Frayne, M.Sc. chimie : Expertise en spectrométrie de masse (GC-MS), préparation/analyse d'échantillons, des données et des résultats; Courriel : isabelle.robillard-frayne@mhi-rc.org

Julie Thompson Legault, M.Sc.nutrition : Expertise en métabolomique et coordination d'étude clinique; Courriel : julie.thompson@mhi-rc.org

Projet(s) de recherche

Les principaux projets en cours sont subventionnés par des organismes avec comités de pairs, soit les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC), Génome Canada/Québec, la Fondation canadienne pour l'innovation (FCI).

  1. “Metabolic investigations using mass isotopomer analysis: A paradigm for biomarker and therapy discovery.” IRSC (2010-2015); subvention de fonctionnement; rôle: Investigateur principal (IP) (2 co-applicants).
  2. « Emerging team in the Leigh Syndrome French Canadian Type (LSFC): Translating LSFC gene discovery into treatments for patients.” IRSC (2010-2015); Subvention d’équipe; rôle: Chef d’équipe (7 co-applicants).
  3. “IBD Genomic Medicine Consortium (iGenoMed): translating genetic discoveries into a personalized approach to treating inflammatory bowel diseases.” Genome Canada (2012-2016). Rôle : Co-applicant (IP : Drs J. Rioux et A. Bitton; 9 co-applicants); responsable du volet métabolomique.
  4. Discovery, development and validation of biomarkers and theragnostic approaches. FCI (2009-2014). Rôle: Co-applicant (IP: Dr JC Tardif; 3 co-applicants); responsable du volet métabolomique.

Publications

Pubmed : C. Des Rosiers

Liens

Association de l'Acidose lactique

Integrative genomic medicine

Prix et distinctions

Les étudiants du laboratoire sont souvent récompensés pour leurs présentations orales ou par affiche lors des Journées de la Recherche de l'Institut de Cardiologie de Montréal.

La plupart de nos étudiants sont également financés par des bourses octroyées par divers organismes.

Anciens étudiants :

Matthieu Ruiz
2014, 2017 et 2018 : Prix pour présentations orales et par affiche, congrès SQLNM-CMDO-COLosSUS
2017: “William C. Stanley” Early Investigator award, congrès SHVM, Allemagne
2016 et 2017 : 1er prix présentation par affiche, niveau post-doctorat, ICM
2017 : Prix d’excellence pour une communication orale, congrès SQLNM-CMDO-COLosSUS
2017: Récipiendaire du ASBMB Graduate/Postdoctoral Travel award, EB 2017, Chicago, USA.
2016 : 1er prix présentation orale, département de nutrition, UdeM
2014 : 1er prix séminaire post-doctoral et 1er prix présentation orale niveau post-doctorat, ICM
2014 : Lauréat sélectionné sur critères d’excellence académique par le CMDO pour participation invitée aux 2nd ICAN (Institute of Cardiometabolism And Nutrition) Conference Series, France

Sandra Therrien-Laperrière

2017 : Travel award- Experimental Biology, ASMBM
2016: Bourse d’excellence, FESP Université de Montréal
2016 : 1er prix présentation par affiche, niveau maîtrise, ICM

Yvette Mukanesa
2017: Travel award – Experimental Biology, ASBMB
2014 et 2016: Bourse d’excellence académique et du MSSS, Quebec Black Medical Association 2014: 1er prix présentation par affiche niveau doctorat, ICM
2014-2015: Bourse CORAMH
2011-2017: Bourses de la faculté de médecine, du département de nutrition et FESP, UdeM

Sarah Cherkaoui
2015: Travel award, International Conference of the Metabolomics Society
2013-2015 : Bourse de maîtrise, FESP, UdeM
2014 : 1er prix présentation par affiche niveau maîtrise - Département de Biochimie – UdeM

Cécile Martel
2013 : 1er prix présentation par affiche niveau post-doctorat, ICM
2013-15 : Bourse post-doctorale FRQS

Marie-Eve Rivard
2010: 1er prix présentation orale niveau maîtrise, ICM

Julie Thompson-Legault
2012 : CORAMH
2011 et 2012 : Fondation Go (devenue fondation du Grand défi Pierre Lavoie)
2010-2012 : Bourse de maîtrise FRQS

Roselle Gélinas
2011 : Bourse «Graduate/Postdoctoral travel award», ASBMB 2011, USA
2011: Prix et bourse “Early Investigator Competition”, Society for Heart and Vascular Metabolism, Belgique
2009-2011: Bourse Ph.D. IRSC
2007 et 2009 : 1er et 2e prix pour meilleure présentation orale niveau doctorat, ICM
2008 : Bourse pour étudiant au Ph.D. (rédaction), Département de Nutrition, UdeM
2006 et 2008 : Bourse de voyage pour congrès (EB 2007, 2009), Département de Nutrition, UdeM
2006 et 2008 : 3e et 2e prix pour la meilleure présentation par affiche niveau doctorat, ICM
2006 et 2007 : Bourse pour étudiant au Ph.D, Département de Nutrition, UdeM
2004 et 2005: Bourse pour étudiant gradué, Département de Nutrition, UdeM

Dominic Lachance
2012 : 2e prix présentation par affiche niveau post-doctorat, ICM
2012-2014 : Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)
2010-2012 : Bourse post-doctorale FRQS et Fondation des maladies du cœur du Canada (FMCC)

Benjamin Lauzier
2011-2012 : Bourse post-doctorale de la FMCC

Fanny Vaillant
2012 : 1er prix présentation orale niveau post-doctorat, ICM
2011: 1er prix de présentation d'un séminaire niveau post-doctorat, ICM

Contact

metabolomique.icm@mhi-rc.org
514 376-3330, poste 2133